Identificacao de novos alvos cardiacos atraves da analise de ESTs

Identificacao de novos alvos cardiacos atraves da analise de ESTs

Título alternativo ESTs analysis to identify new cardiac targets
Autor Majumder, Paromita Autor UNIFESP Google Scholar
Resumo Objetivo: O objetivo deste estudo e a identificacao e analise de expressed sequence tags (ESTs) especificos de coracao humano disponiveis em bancos de dados de sequencia publica. Metodos: Foram explorados dados advindos do projeto transcriptoma de quatro diferentes fontes: OMIN, SAGE, UniGene (secao humana) e Brazilian Human Genome Project (HCGP) com a utilizacao do banco relacional SQL. Resultados: Foram identificados 23 bibliotecas de cDNA de coracao que contem 55.963 ESTs de coracao. Estas sequencias formam 11.699 clusters no banco UniGene. Destes, 497 sao expressos exclusivamente em coracao e 411 nao possuem anotacao. Esses clusters sem anotacao contem 562 sequencias. Os elementos repetitivos destas ESTs foram mascarados pelo programa Repeat Masker. O ESTScan foi utilizado para predicao de regiao codificante nas 562 sequencias, 86 foram identificadas como ESTs open reading frame (ORFs) com 12 por cento de falsos positivos. Conclusao: Esses dados destacam a inespecificidade de informacao disponivel nos bancos de dados de sequencias advindos de genes expressos exclusivamente em coracao humano. Esse conhecimento e essencial para o entendimento de mecanismos) moleculares associados a funcao do orgao e ao desenvolvimento de patologias cardiovasculares
Assunto Etiquetas de Sequências Expressas
Coração
Idioma Português
Data 2001
Publicado em São Paulo: [s.n.], 2001. 63 p. ilustab.
Editor Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Extensão 63 p.
Direito de acesso Acesso restrito
Tipo Dissertação de mestrado
URI http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/17735

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